Con parte de la historia cambiada, Trunks estaría presente en el despertar de estos androides, donde sería derrotado fácilmente por estos. También vería la aparición de Cell con sus propios ojos y las cosas se complicarían ya que este logrará absorber al androide #17 y luego al #18 volviéndose perfecto. Antes de esto Goku lo llevó junto con su padre a entrenar en la Sala del Espíritu y del Tiempo donde superaría a sus padre sin problemas. Ya en el Cell Game, sería derrotado por los Cell Jr. y salvado por un furioso Gohan en Super Saiyajin 2. Cuando todos creían a Cell muerto, este reapareció asesinando a Trunks, después sería revivido por las Esferas del Dragón. Finalmente Gohan destruiría a Cell. Después de esto volvería a su futuro para tener una vida tranquila junto a su madre. Este muchacho es hijo de uno de los sujetos más poderoso del universo, puesto que su padre es el Príncipe de los Saiyajins conocido como Vegeta. Dejó boquiabierto a su padre cuando entrenaba junto a él y logró convertirse en Super Saiyajin a la corta edad de siete años. Junto con su mejor amigo, Goten, participarían del 25 Torneo de las Artes Marciales, aunque solo pudieron hacerlo en la categoría Junior. Se enfrentaría en la final contra Goten, ganando con su experiencia sobre su amigo. No contento con este Torneo, se infiltraría en el Torneo Mayor disfrazándose de Mighty Mask (por supuesto después de haber golpeado y quitado el traje a este).

 Serían eliminados por la androide #18 tras descubrir su fraude. Después de esta experiencia, el joven Trunks tendría que hacer frente a la muerte de su padre, que se sacrificaría en vano para destruir a Majin Boo. Esto provocó que el joven Saiyajin y su amigo Goten se verían involucrados en esta lucha contra el mal utilizando por primera vez la técnica de la fusión aprendida en el otro mundo por Goku de manos de un habitante del Planeta Metamoru. Unido a Goten bajo la figura de Gotenks, este ultimo ultimo lucharía contra Majin Boo en el estado de Super Saiyajin 3. A pesar de todo, no podrían eliminar al monstruo ya que la fusión duraba 5 minutos. Poco después fueron absorbidos por Majin Boo aumentando el poder del monstruo. Solo Goku y Vegeta lograrían rescatarlos del interior del demonio, aunque pocos instantes después morirían en la explosión de la Tierra. Finalmente fueron resucitados y cedieron su energía a Goku para la Genkidama que destruiría a Goku. Trunks se transformaría en el Presidente de Capsule Corp. Con 23 años viajaría al espacio junto con Goku y Pan para buscar las Esferas de estrella negra. Tras un intenso viaje lleno de aventuras regresaría a la Tierra para luchar contra Baby, donde sería poseído por el mismo y luego liberado por Kaio Shin gracias al agua ultra - sagrada. Después de eso luchó contra el Super Androide #17, donde fue derrotado por la fuerza superior de éste y colaboró como pudo en la lucha contra los dragones.